新的医疗器械代理制未来的发展方向有如下几点：
1.市场营运规程的出现取代简单的经销合同，升级成为战略合作伙伴关系的医疗器械代理商合作的时段将以5年为最小合作单位，企业将介入医疗器械代理商团队组织体系中的管理。 运营规程是彼此分工协作的法定文件，将超越盟约而涵盖履约的完整实施细节。
2.从简单的经济联系走向合营参股类的政治联姻，不再是局限于上游提供产品和服务、下游建网络推销产品的简单供给关系，而是企业经营战略上的一个组织内团体。
3.专业化的繁衍。这里的专业化不是指产品推广专业化，而是医疗器械代理层次的分类专业化，企业和经销团队分别的管理素质专业化。 比如，企业派驻地方医疗器械代理团队的帮控人员不是医药专业人员，而是来自行政、财务的专业人才，这类人才的介入是企业真正的服务到位和管理升级。
4.由底价转化为半高开或高开，工业企业将面临财税处理问题。
无论是工业企业还是医疗器械代理商，都必须顺应市场发展，尽快建立起具有超竞争优势、有中国特色的专业化医疗器械代理新模式。只有这样，才能把握发展新契机！